Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TspoP50637 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms