Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl5P50228 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl5P50228 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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