Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms