Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms