Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms