Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf5P43027 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdf5P43027 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdf5P43027 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdf5P43027 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms