Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxrgP28705 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms