Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nckap1P28660 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nckap1P28660 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms