Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms