Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms