Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BrafP28028 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BrafP28028 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms