Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6aP27664 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms