Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klra1P20937 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klra1P20937 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms