Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18526 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18526 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18526 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18526 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P18526 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18526 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18526 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18526 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18526 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18526 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18526 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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