Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpraP18052 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms