Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms