Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms