Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgbP16014 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgbP16014 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgbP16014 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms