Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms