Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prf1P10820 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms