Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LtaP09225 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtaP09225 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtaP09225 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtaP09225 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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