Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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