Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-AaP01910 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-AaP01910 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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