Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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