Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns1O88456 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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