Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnal1O88327 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms