Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm10509O88255 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm10509O88255 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms