Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtssO70370 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtssO70370 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtssO70370 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CtssO70370 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms