Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SlkO54988 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SlkO54988 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SlkO54988 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SlkO54988 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms