Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffbO54788 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffbO54788 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffbO54788 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffbO54788 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DffbO54788 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffbO54788 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms