Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sp100O35892 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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