Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clk3O35492 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clk3O35492 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clk3O35492 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk3O35492 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk3O35492 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk3O35492 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk3O35492 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk3O35492 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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