Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc18a3O35304 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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