Protein–RNA interactions for Protein: O35199

Vmn2r89, Putative pheromone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r89O35199 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Vmn2r89O35199 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn2r89O35199 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms