Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ArxO35085 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ArxO35085 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ArxO35085 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ArxO35085 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ArxO35085 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ArxO35085 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ArxO35085 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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ArxO35085 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ArxO35085 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ArxO35085 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms