Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms