Protein–RNA interactions for Protein: O08746

Matn2, Matrilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn2O08746 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn2O08746 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms