Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3aO08665 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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