Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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