Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms