Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm2888K7N746 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2888K7N746 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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