Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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