Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim22J3QP37 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim22J3QP37 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim22J3QP37 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim22J3QP37 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim22J3QP37 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms