Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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