Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms