Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms