Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm28048F7BCN0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm28048F7BCN0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28048F7BCN0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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