Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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