Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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