Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms